Bonjour,
Pour 2 jours sur place, je vous conseille un Roma pass 48h avec un musée gratuit, les transports gratuits si vous comptez visiter un musée autre que le Vatican.
Pour réserver une entrée aux musées du Vatican, vous pouvez le faire en ligne, sur le lien figurant en bas de page
Rome1.com > Vatican Musées chapelle Sixtine > Musées du Vatican et chapelle sixtine.
Mais la basilique ne sera pas en coupe-file sauf en suivant le lien de la page
Basilique Saint Pierre.